Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Slc5a7-201ENSMUST00000095712 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr628-201ENSMUST00000098193 1553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Oard1-201ENSMUST00000046651 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
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Sh3bp1P55194 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sh3bp1P55194 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms