Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SrprbP47758 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms