Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Zfp408-202ENSMUST00000111333 3740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Dpp6-202ENSMUST00000101471 4491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms