Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Prc1-210ENSMUST00000174172 3008 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm5883-201ENSMUST00000120735 495 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Trp53-ps-201ENSMUST00000166597 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1043-201ENSMUST00000099907 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pign-210ENSMUST00000190811 3015 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC156790.4-202ENSMUST00000228838 1418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms