Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Cyp17a1-201ENSMUST00000026012 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Kif26b-202ENSMUST00000161017 13749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Rnf39A2RT81 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Rnf43-209ENSMUST00000165679 4310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rnf39A2RT81 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms