Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3550W4VSN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3550W4VSN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms