Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vstm4T1NXB5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vstm4T1NXB5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vstm4T1NXB5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms