Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt6bQ9Z331 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt6bQ9Z331 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt6bQ9Z331 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms