Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hdac5Q9Z2V6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac5Q9Z2V6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms