Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hdac6Q9Z2V5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac6Q9Z2V5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms