Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsc22d3Q9Z2S7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tsc22d3Q9Z2S7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms