Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mbd3Q9Z2D8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mbd3Q9Z2D8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms