Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccne2Q9Z238 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccne2Q9Z238 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccne2Q9Z238 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms