Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lgr5Q9Z1P4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lgr5Q9Z1P4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lgr5Q9Z1P4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms