Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfkbiaQ9Z1E3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfkbiaQ9Z1E3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms