Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Setbp1Q9Z180 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Setbp1Q9Z180 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setbp1Q9Z180 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms