Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Shcbp1Q9Z179 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Shcbp1Q9Z179 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms