Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne6Q9Z140 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne6Q9Z140 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms