Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pmfbp1Q9WVQ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms