Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nme3Q9WV85 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nme3Q9WV85 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nme3Q9WV85 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms