Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ArcQ9WV31 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ArcQ9WV31 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ArcQ9WV31 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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ArcQ9WV31 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ArcQ9WV31 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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