Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnip1Q9WUU8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnip1Q9WUU8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tnip1Q9WUU8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms