Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scnn1bQ9WU38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scnn1bQ9WU38 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms