Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod1Q9R0E2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Plod1Q9R0E2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms