Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Wdr54Q9R0D8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms