Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lamc3Q9R0B6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lamc3Q9R0B6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Lamc3Q9R0B6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms