Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fhl3Q9R059 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fhl3Q9R059 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms