Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf4Q9QZS2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf4Q9QZS2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms