Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a3Q9QZS0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col4a3Q9QZS0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Col4a3Q9QZS0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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