Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp21Q9QZL6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp21Q9QZL6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms