Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ripk3Q9QZL0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ripk3Q9QZL0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms