Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nr4a3Q9QZB6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms