Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Irx4Q9QY61 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Irx4Q9QY61 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms