Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Plxnb3Q9QY40 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Plxnb3Q9QY40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms