Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcb11Q9QY30 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcb11Q9QY30 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms