Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Foxe3Q9QY14 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Foxe3Q9QY14 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms