Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opn4Q9QXZ9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opn4Q9QXZ9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opn4Q9QXZ9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opn4Q9QXZ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn4Q9QXZ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms