Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpsf3Q9QXK7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpsf3Q9QXK7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpsf3Q9QXK7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms