Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad18Q9QXK2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rad18Q9QXK2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms