Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trp53inp1Q9QXE4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trp53inp1Q9QXE4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms