Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc5Q9QX29 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trpc5Q9QX29 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc5Q9QX29 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms