Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkl2Q9QUK0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms