Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Reep6Q9JM62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Reep6Q9JM62 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms