Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trpc4apQ9JLV2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc4apQ9JLV2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms