Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm1Q9JLF6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tgm1Q9JLF6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms