Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chrac1Q9JKP8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms