Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms