Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin1Q9JKF6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms