Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem3Q9JKE1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trem3Q9JKE1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms