Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Uchl3Q9JKB1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Uchl3Q9JKB1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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